确定致病机制 1. 皇后确诊乳腺癌 2. 药物遍寻均无效 3. 精准医疗项目启动 生物信息分析 特异化突变基因鉴定 蛋白通路与疾病关联性 XYZ蛋白三维晶体结构 XYZ蛋白药物结合口袋突变前后分析 先导化合物 1. 计算机辅助药物设计: 在 蛋白质三维结构基础上，彻底分析突变后XYZ蛋白结合口袋周围理化性质
突变前：小分子包围在疏水口袋，亲水氨基酸R125、E154与其形成氢键铆钉作用，使其牢牢稳固在蛋白质中 突变后：疏水环境大致不变，但氨基酸N125、I154(无法形成氢键)造成很大空隙，亲水性转换为疏水口袋，稳定性降低 2. 分子动力学方法 分子动力学方法对XYZ蛋白突变后与小分子Hormone间相互作用状况进行了计算模拟分析, 目的:以期得到蛋白质在突变后的小分子结合信息
计算中心首席科学家是这么解释分析结果的:
突变后XYZ蛋白Region A区域没有变化，对该部分不做任何修改； Region B区域中，小分子下方出现巨大空洞，需要对该部分进行补漏； Region B区域巨大空袭，在小分子稳定结合时，下方出现由10~13个水分子组成的“水氢键网络体系”； “水氢键网络体系”中，水分子能量Energy（球体大小）和占有率Occupancy（球体颜色）均能表达出蛋白质局部区域理化性质。 > 具体总结：Region B区域绝大多数水分子能量Energy极小、占有率Occupancy较小，说明该区域极为疏水；但其中W1水分子，能量较好、占有率较高，说明W1水分子极为稳定，周围氨基酸为极亲水性氨基酸，将来可以通过替换W1水分子或通过桥键作用对其进行化学修饰 ; ;
3. 基于体内原生激素Hormone的药物设计:化学片段增长设计法 首先设计的化学片段，将能够有效的到达W1水分子附近或将其替换掉, 福斯坦国立大学化学院研究团队，共设计母核结构50枚，且均具备有机合成实验方法实现的可能性
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4. 分子对接方法判定最佳化学母核结构 利用分子对接方法，将50枚母核结构分别对接进入突变后蛋白质XYZ结构中， 利用分子对接权重值, 判定3枚小分子药物在对接结果中占据较好的权重位置。奥古斯汀·Khan将此结果呈现给，福斯坦国立大学化学院研究团队，经过再三斟酌分析，决定采用C2、C1和C3进行后期化学结构改造
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